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泛生子发表UVC变异识别专利算法

2021-11-16 18:37

    本报记者 姜楠

    2021年11月15日,泛生子(纳斯达克代码:GTH)宣布在生物信息学权威期刊、牛津大学出版社出版的《生物信息学简报》(Briefings in Bioinformatics)上发表了新的变异识别算法UVC(Unity-of-opposites small Variant Caller,对立统一变异识别),及使用该算法在变异识别性能上的显著提升的结果。研究结果表明,UVC算法作为泛生子生物信息学平台的重要组成部分,可应用于所有二代测序平台,在准确检测癌症突变方面具有广阔应用前景。

    体细胞变异体的准确检测对癌症的诊断、预后和治疗监测至关重要。为此,泛生子自主开发了可应用于所有二代测序平台的UVC专利算法,以优化对变异体的识别过程。

    据了解,该论文描述了UVC跟其他有类似功能的变异识别算法相比的性能优越性,并采用以下数据集做性能评估:GIAB胚细胞变异真实数据集,192个计算机混样模拟的肿瘤样本(模拟不同的肿瘤/对照的深度/纯度),GIAB体细胞变异真实数据集,以及用HCC1395乳腺癌细胞株构建的SEQC2体系变异参考数据集。在使用某个71-基因panel产品检测16个肠癌患者的数据集上的评估结果显示:UVC反映出的结果与多个第三方研究员人工审核结果的一致率达到100%。

    泛生子联合创始人及首席执行官王思振表示:“很高兴我们的生物信息团队在变异识别算法领域取得了创新突破,使泛生子检测产品拥有更高的灵敏度与精确性。未来泛生子将进一步实现对UVC算法的深度应用,通过算法及产品优化,进一步赋能泛生子的癌症全周期检测与诊断,推动泛生子产品在临床端的广泛应用,为广大患者提供更精准、更可及的医疗服务。”

(编辑 田冬)

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